تشخیص قطعات نوکلئوتیدی مشخص از ژنوم نمونه مورد بررسی، توسط پنل‌های تخصصی طراحی شده بر اساس طول قطعه از یکدیگر تفکیک شده و در قالب یک فایل الکترونیکی تولید می­شود. کاربرد استفاده از قطعات DNA خاص در علم ژنتیک بسیار گسترده بوده و در انواع بیماری­ها و روش­های تخصصی استفاده می‌شوند، از جمله این روش­ها تست QF-PCR، تعیین هویت انسانی و تعیین گونه جانوری، تکنیک MLPA، روشMSI  یا استفاده از تکرارهای پشت سر هم (STR) را می­­توان نام برد که تمام این روش‌ها بر اساس بررسی قطعات نوکلئوتیدی (Fragment DNA)  پایه‌ریزی شده‌اند و جهت رسیدن به نتیجه به لحاظ سایز قطعات و رنگ‌های لیبل شده در دستگاه ژنتیک آنالایزر Run شوند و مورد بررسی قرار گیرند.